Note: This thread is related to #Coronavirus #COVID19

Follow the World Health Organization's instructions to reduce your risk of infection:

1/ Frequently clean hands by using alcohol-based hand rub or soap and water.

2/ When coughing and sneezing cover mouth and nose with flexed elbow or tissue - throw issue away immediately and wash hands.

3/ Avoid close contact with anyone that has fever and cough.

Mathieu M.J.E. Rebeaud+ Your Authors @Damkyan_Omega MScEng. PhD Candidate in Protein Biochemistry at #DBMV in @goloubinofflab @UNIL. Grumpy Vegan. Metalhead. Member of @PSSuisse @nofake_science @fakemedecine May. 04, 2020 9 min read + Your Authors

L'article sorti dans Nature (@KroganLab) est assez incroyable et le Prof. Nevan Krogan, le PI en charge de cette recherche en a discuté sur The Conversation. Je vous livre ici une traduction en français.

Étude:  https://www.nature.com/articles/s41586-020-2286-9 

[Thread] Nous avons trouvé et testé 47 anciens médicaments qui pourraient traiter le coronavirus : Les résultats montrent des pistes prometteuses et une toute nouvelle façon de lutter contre le COVID-19

Traduction de cet article:  https://theconversation.com/we-found-and-tested-47-old-drugs-that-might-treat-the-coronavirus-results-show-promising-leads-and-a-whole-new-way-to-fight-covid-19-136789?utm_medium=Social&utm_source=Twitter#Echobox=1588273580 

Plus les chercheurs en savent sur la façon dont le coronavirus s'attache, envahit et détourne les cellules humaines, plus la recherche de médicaments pour le combattre est efficace. C'était l'idée que mes collègues et moi espérions réaliser lorsque nous avons commencé à dresser

une carte du coronavirus il y a deux mois. Cette carte montre toutes les protéines du coronavirus et toutes les protéines du corps humain avec lesquelles ces protéines virales pourraient interagir.

En théorie, toute intersection sur la carte entre les protéines virales et

humaines est un endroit où des médicaments pourraient combattre le coronavirus. Mais au lieu d'essayer de développer de nouveaux médicaments pour travailler sur ces points d'interaction, nous nous sommes tournés vers les plus de 2 000 médicaments uniques déjà approuvés par la FDA

pour l'usage humain. Nous pensions que, sur cette longue liste, il y aurait quelques médicaments ou composés qui interagissent avec les mêmes protéines humaines que le coronavirus.

Nous avions raison.

Notre équipe multidisciplinaire de chercheurs de l'université de Californie

à San Francisco, appelée QCRG, a identifié 69 médicaments et composés existants susceptibles de traiter le COVID-19. Il y a un mois, nous avons commencé à expédier des boîtes de ces médicaments à l'Institut Pasteur à Paris et à Mount Sinai à New York pour voir s'ils combattent

effectivement le coronavirus.

Au cours des quatre dernières semaines, nous avons testé 47 de ces médicaments et composés en laboratoire contre des coronavirus vivants. Je suis heureux d'annoncer que nous avons identifié des pistes de traitement solides et mis en évidence deux

mécanismes distincts pour la façon dont ces médicaments affectent l'infection par le SARS-CoV-2.
Chaque endroit où une protéine du coronavirus interagit avec une protéine humaine est un site potentiel de médication.

La carte que nous avons élaborée et le catalogue de médicaments de la FDA que nous avons consulté ont montré qu'il existait des interactions potentielles entre le virus, les cellules humaines et les médicaments ou composés existants. Mais nous ne savions pas si les médicaments

que nous avons identifiés rendraient une personne plus résistante au virus, plus susceptible ou feraient quoi que ce soit.

Pour trouver ces réponses, nous avions besoin de trois choses : les médicaments, le virus vivant et les cellules dans lesquelles les tester. Il serait

optimal de tester les médicaments dans des cellules humaines infectées. Cependant, les scientifiques ne savent pas encore quelles cellules humaines fonctionnent le mieux pour étudier le coronavirus en laboratoire. Nous avons donc utilisé des cellules de singe vert africain, qui

sont fréquemment utilisées à la place des cellules humaines pour tester les médicaments antiviraux. Elles peuvent être facilement infectées par le coronavirus et réagissent aux médicaments de manière très proche de celle des cellules humaines.

Après avoir infecté ces cellules de singe avec un virus vivant, nos partenaires à Paris et à New York ont ajouté les médicaments que nous avons identifiés à la moitié et ont gardé l'autre moitié comme contrôle. Ils ont ensuite mesuré la quantité de virus dans les échantillons et

le nombre de cellules vivantes. Si les échantillons contenant des médicaments présentaient un nombre de virus inférieur et plus de cellules vivantes que le témoin, cela suggérerait que les médicaments perturbent la réplication virale. Les équipes ont également cherché à

déterminer la toxicité des médicaments pour les cellules.
Avec des dizaines de médicaments nécessitant chacun des tests complets, obtenir des résultats en quatre semaines demandait un effort continu.

Après avoir trié les résultats de centaines d'expériences utilisant 47 des

médicaments prévus, il semble que nos prévisions d'interaction étaient correctes. Certains de ces médicaments agissent en effet pour combattre le coronavirus, tandis que d'autres rendent les cellules plus sensibles à l'infection.

Il est incroyablement important de se rappeler qu'il s'agit de résultats préliminaires qui n'ont pas été testés sur des personnes. Personne ne devrait sortir et acheter ces médicaments.

Mais les résultats sont intéressants pour deux raisons. Non seulement nous avons trouvé des

médicaments individuels qui semblent prometteurs pour combattre le coronavirus ou qui pourraient rendre les gens plus sensibles à ce virus, mais nous savons, au niveau cellulaire, pourquoi cela se produit.

Nous avons identifié deux groupes de médicaments qui affectent le virus

et qui le font de deux manières différentes, dont l'une n'a jamais été décrite. À la base, les virus se propagent en entrant dans une cellule, en détournant une partie de la machinerie de la cellule et en l'utilisant pour faire d'autres copies du virus. Ces nouveaux virus

continuent ensuite à infecter d'autres cellules. Une étape de ce processus consiste pour la cellule à fabriquer de nouvelles protéines virales à partir de l'ARN viral. C'est ce qu'on appelle la traduction.

En parcourant la carte, nous avons remarqué que plusieurs protéines

virales interagissaient avec les protéines humaines impliquées dans la traduction et qu'un certain nombre de médicaments interagissaient avec ces protéines. Après les avoir testés, nous avons trouvé deux composés qui perturbent la traduction du virus.

Ces deux composés sont appelés ternatin-4 et zotatifine. Tous deux sont actuellement utilisés pour traiter le myélome multiple et semblent combattre COVID-19 en se liant aux protéines nécessaires à la traduction et en les inhibant dans la cellule.

La plitidepsine est une

molécule similaire à la ternatin-4 et fait actuellement l'objet d'un essai clinique pour traiter COVID-19. Le second médicament, la zotatifine, agit sur une protéine différente impliquée dans la traduction. Nous travaillons avec le PDG de la société qui le produit pour le faire

passer le plus rapidement possible en essais cliniques.
Le coronavirus s'attaque aux cellules humaines par des dizaines d'astuces.

Le deuxième groupe de médicaments que nous avons identifié fonctionne d'une manière totalement différente.

Les récepteurs cellulaires se trouvent à la fois à l'intérieur et à la surface de toutes les cellules. Ils agissent comme des interrupteurs spécialisés. Lorsqu'une molécule

spécifique se lie à un récepteur spécifique, cela indique à une cellule d'accomplir une tâche spécifique. Les virus utilisent souvent les récepteurs pour infecter les cellules.

Notre carte originale a identifié deux récepteurs prometteurs des cellules MV pour les traitements

médicamenteux, SigmaR1 et SigmaR2. Les tests ont confirmé nos soupçons.

Nous avons identifié sept médicaments ou molécules qui interagissent avec ces récepteurs. Deux antipsychotiques, l'halopéridol et la melperone, qui sont utilisés pour traiter la schizophrénie, ont montré une

activité antivirale contre le SRAS-CoV-2. Deux puissants antihistaminiques, la clemastine et la cloperastine, ont également montré une activité antivirale, tout comme le composé PB28 et l'hormone féminine progestérone.

N'oubliez pas que toutes ces interactions n'ont été observées jusqu'à présent que dans des cellules de singe en boîtes de Pétri.

À l'heure actuelle, nous ne savons pas exactement comment les protéines virales manipulent les récepteurs SigmaR1 et SigmaR2. Nous pensons que le

virus utilise ces récepteurs pour aider à faire des copies de lui-même, de sorte que la diminution de leur activité inhibe probablement la réplication et réduit l'infection.

Il est intéressant de noter qu'un septième composé - un ingrédient que l'on trouve couramment dans les

antitussifs, appelé dextrométhorphane - fait le contraire : Sa présence aide le virus. Lorsque nos partenaires ont testé des cellules infectées avec ce composé, le virus a pu se répliquer plus facilement, et davantage de cellules sont mortes.
Les tests en laboratoire sont

excellents pour générer des pistes, mais des essais cliniques doivent être effectués pour savoir si ces résultats se traduisent dans le monde réel. Il s'agit d'une découverte potentiellement très importante, mais, et je ne saurais trop insister sur ce point, d'autres tests sont

nécessaires pour déterminer si le sirop contre la toux contenant cet ingrédient doit être évité par une personne atteinte de COVID-19.

Toutes ces découvertes, bien que passionnantes, doivent faire l'objet d'essais cliniques avant que la FDA ou toute autre personne ne décide de

prendre ou d'arrêter de prendre l'un de ces médicaments en réponse à COVID-19. Ni les gens, ni les décideurs politiques, ni les médias ne doivent paniquer et sauter aux conclusions. Il est également intéressant de noter que l'hydroxychloroquine - le médicament controversé qui a

donné des résultats mitigés dans le traitement de COVID-19 - se lie également aux récepteurs SigmaR1 et SigmaR2. Mais d'après nos expériences dans les deux laboratoires, nous ne pensons pas que l'hydroxychloroquine se lie efficacement à ces récepteurs.

Les chercheurs savent

depuis longtemps que l'hydroxychloroquine se lie facilement aux récepteurs du cœur et peut causer des dommages. En raison de ces différences dans les tendances de liaison, nous ne pensons pas que l'hydroxychloroquine soit un traitement fiable.

Les essais cliniques en cours devraient bientôt permettre de clarifier ces inconnues.

(Ce qu'on dit tous, note de moi-même. cc @MathieuMolimard @FZores @fluidloading )

Notre idée était qu'en comprenant mieux comment le coronavirus et le corps humain interagissent, nous pourrions trouver des traitements parmi les milliers de médicaments et de composés qui existent déjà.

Notre idée a fonctionné. Nous avons non seulement trouvé de nombreux

médicaments susceptibles de combattre le SARS-CoV-2, mais nous avons aussi appris comment et pourquoi.

Mais ce n'est pas la seule chose qui nous enthousiasme. Ces mêmes protéines que le CoV-2 du SARS utilise pour infecter et se répliquer dans les cellules humaines et qui sont

ciblées par ces médicaments sont également détournées par les coronavirus apparentés SARS-1 et MERS. Ainsi, si l'un de ces médicaments fonctionne, il sera probablement efficace contre COVID-22, COVID-24 ou toute autre itération de COVID qui pourrait apparaître.

Ces pistes

prometteuses auront-elles un quelconque effet ?

L'étape suivante consiste à tester ces médicaments sur l'homme. Nous avons déjà commencé ce processus et, grâce à ces essais, les chercheurs examineront des facteurs importants tels que le dosage, la toxicité et les interactions

bénéfiques ou néfastes potentielles dans le contexte de COVID-19.

Et voilà. C'est super bien foutu et le papier est très bon. Maintenant, à voir ce qu'on peut en faire. cc @ElVeider_FDV @kendette @Le___Doc @OlivierHertel @Barbusceptique @fluidloading @Curiolog @EricBillyFR @FZores @Samuel_Mondy @SagittariusHH @caroline_samer @LUppsala

Pardonnez les fautes et les sauts de lignes hasardeux... J'espère que ça reste lisible.

PS: Même là pour ceux qui ATTENDENT QUE J'EN PARLE ABSOLUMENT, oui l'HCQ ça a l'air plus que bof et eux-mêmes recommandent d'attendre des RCT mais sont plus que sceptiques quant à son utilisation en ce basant sur le taux de liaison pas très spécifique et l'IC50.


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